- Denne sang handler om en mand, der for nylig er gået fra sin kone, Isis. Han forlader byen på toppen af en pony på vej 'mod det vilde ukendte land'. Undervejs møder han en lyssky karakter, og de begynder begge at søge efter skatte. Under rejsen bliver manden ved med at tænke tilbage på sin ekskone:
Mens vi red gennem kløfterne, gennem den djævelske kulde
Jeg tænkte på Isis, hvordan hun troede, jeg var så hensynsløs
Den lyssky karakter dør midtvejs i rejsen og efterlader manden til at fortsætte skattejagten alene:
Da han døde, håbede jeg, at det ikke var smitsomt
Men jeg besluttede mig for, at jeg skulle fortsætte
Da han når graven, hvor den formodede skat ligger, bliver manden chokeret over at finde en tom kiste:
Der var ingen juveler eller ingenting, jeg følte, jeg havde fået
Frustreret trækker han sin døde ledsager ind i kisten, inden han beslutter sig for at ride hjem til Isis, 'bare for at fortælle hende, at jeg elsker hende.'
Efter at have stillet spørgsmålstegn ved hans seneste opholdssted, accepterer Isis sin eksmand tilbage. Sangen afsluttes derefter med, at manden overvejer Isis og hendes magnetiske indflydelse:
Isis åh Isis du er et mystisk barn
Det, der driver mig til dig, er det, der driver mig til vanvid - Dette blev skrevet, mens Dylan skiltes fra sin daværende kone, Sara, og derfor mener mange fans, at denne sang hentyder til parrets turbulente forhold. Dette argument understøttes af, at det er med på albummet, Ønske , som afsluttes med den gribende 'Sara', hvor Dylan åbenlyst synger om sin 'strålende juvel, mystiske kone'. Denne biografiske tilgang til at skrive var en sjælden bedrift for Dylan, som normalt foretrak at skrive under personas (som i 'Isis').
- En liveversion af 'Isis' er med på opsamlingsalbummet, biograf . Dylan introducerer den som 'en sang om ægteskab'.
- Den kvindelige karakter i denne sang er opkaldt efter Isis, gudinden i den gamle egyptiske mytologi, der er idoliseret som den ideelle hustru og beskyttende mor.
- 'Isis' var en af syv sange på Ønske co-skrevet mellem Dylan og sangskriver/teaterdirektør, Jacques Levy.
- I deres tidlige år dækkede The White Stripes ofte denne sang.
- Sangens medforfatter Jacques Levy blev spurgt af Dylan-fanzinen Isis om denne sangtitel og dens betydning i egyptisk mytologi. Levy svarede, at det var et forsøg på en gammel westernballade som den slags, The Band plejede at skrive: 'Jamen, det er en lignende slags ting', sagde han, 'og ligesom The Band skrev 'trukket ind i Nazareth', ved godt, 'Isis' har lige så meget med Egypten at gøre, som Fanny har med Nazareth at gøre.'
